METYLÁCIA SHOX2 GÉNU AKO DIAGNOSTICKÝ MARKER KARCINÓMU PLÚC

Karcinóm pl’úc predstavuje celosvetovo najčastejšiu malignitu a hlavnú príčinu smrti a jeho vznik je výsledkom pôsobenia viacerých faktorov, jednak genetických, epigenetických ako aj environmentálnych. Väčšina prípadov karcinómu pl’úc, približne 80-90 %, je spájaných s fajčením. Na základe histológie môžeme nádory pl’úc rozdeliť na nemalobunkové (85 %) a malobunkové karcinómy, pričom toto rozdelenie má výrazný vplyv na klinický manažment, prognózu a liečbu pacientov. Nedostatok efektívnych prostriedkov diagnostiky karcinómu pl’úc v skorých štádiách (pred metastázovaním ochorenia alebo infiltráciou lymfatických uzlín) má za následok vysokú hodnotu 5-ročnej mortality, na úrovni 80-85 %. Aktuálne dáta podporujú dôležitú úlohu genetických a epigenetických markerov v procese karcinogenézy. Pritom najčastejšie pozorované udalosti v rámci tohto ochorenia sú epigenetické zmeny ako napr. metylácie DNA promótorov asociovaných s potláčaním funkcie génov. Gén SHOX2 (short stature homeobox 2 gene) je lokalizovaný na 3. chromozóme (3q25.32), má velkosť 10 kb a pozostáva zo 7 exónov kódujúcich proteín pozostávajúci z 319 aminokyselín. V rámci SHOX2 génu sú lokalizované dve velké CG bohaté oblasti, tzv. CpG ostrovčeky, jeden o velkosti 1 kb na 5'konci a druhý 500 bp dlhý na 3'konci proteínu. Aberantná metylácia SHOX2 je typickým znakom tumorov pl’úc a jej testovanie bolo validované na vzorkách bronchiálnych laváží suspektných pacientov vrátane vzoriek s negatívnym cytologickým nálezom a bez vizuálnej detekcie tumoru zobrazovacími metódami. Marker metylácie SHOX2 v krvnej plazme bol však taktiež publikovaný ako špecifický a senzitívny diagnostický test, a preto je dôležité podrobne preskúmať benefity a limity tejto neinvazívnej analýzy v porovnaní s testom bronchiálnej laváže.